Наталія Володимирівна Щоткіна базову медичну освіту отримала в Першому медичному коледжі, закінчивши в 2005 році учбовий заклад по спеціальності «Лабораторна справа». В 2009 році здобула вищу освіту в Київському національному університеті ім. Тараса Шевченка за спеціальністю «Біологія», а в 2011 році отримала ступінь магістра за спеціальністю «Мікробіологія та вірусологія».